Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
NEDD9Q14511 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NEDD9Q14511 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
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