Protein–RNA interactions for Protein: Q14094

CCNI, Cyclin-I, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNIQ14094 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCNIQ14094 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCNIQ14094 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms