Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GTF2H3Q13889 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
GTF2H3Q13889 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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