Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
TUBA3CQ13748 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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TUBA3CQ13748 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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TUBA3CQ13748 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
TUBA3CQ13748 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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