Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
FHL3Q13643 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FHL3Q13643 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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