Protein–RNA interactions for Protein: Q13641

TPBG, Trophoblast glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGQ13641 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TPBGQ13641 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TPBGQ13641 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms