Protein–RNA interactions for Protein: Q13591

SEMA5A, Semaphorin-5A, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5AQ13591 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5AQ13591 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SEMA5AQ13591 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms