Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MKRN4PQ13434 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MKRN4PQ13434 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
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