Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 HERPUD1-204ENST00000439977 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.022e-12■■■■■ 31.3
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PABPC4Q13310 DCAF11-204ENST00000446197 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.181e-13■■■■■ 31.3
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PABPC4Q13310 DCAF11-202ENST00000396936 2469 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.351e-13■■■■■ 31.3
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PABPC4Q13310 PYGO2-202ENST00000368457 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 31.2
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PABPC4Q13310 PIGT-264ENST00000640585 2203 ntTSL 516.46■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 31.1
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PABPC4Q13310 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.894e-9■■■■■ 31.1
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PABPC4Q13310 LAMTOR1-202ENST00000535107 619 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-9■■■■■ 31.1
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PABPC4Q13310 ZNHIT3-210ENST00000620863 881 ntTSL 210.01□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 31.1
PABPC4Q13310 ZNHIT3-204ENST00000617429 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.812e-8■■■■■ 31.1
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PABPC4Q13310 ZNHIT3-203ENST00000616269 616 ntTSL 38.73□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 31.1
PABPC4Q13310 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.22e-8■■■■■ 31.1
PABPC4Q13310 ZNHIT3-205ENST00000617922 4420 ntTSL 26.67□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 31.1
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PABPC4Q13310 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 31
PABPC4Q13310 POP4-202ENST00000585603 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.741e-6■■■■■ 31
PABPC4Q13310 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.59e-9■■■■■ 31
PABPC4Q13310 NGDN-201ENST00000397154 2204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.79e-9■■■■■ 31
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