Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
CHAF1BQ13112 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CHAF1BQ13112 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
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