Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GRIK2Q13002 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GRIK2Q13002 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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