Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NFX1Q12986 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NFX1Q12986 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
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