Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAF2Q12933 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAF2Q12933 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms