Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 IRC9YJL142C 393 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 SPC3YLR066W 555 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 EMG1YLR186W 759 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 CDC42YLR229C 576 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YLR462WYLR462W 609 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 MRM1YOR201C 1239 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 REI1YBR267W 1182 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 CUS1YMR240C 1311 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 NOC2YOR206W 2133 nt3.88□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RAD52YML032C 1416 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 NSE3YDR288W 912 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 PAD1YDR538W 729 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 ACP1YKL192C 378 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 TVP38YKR088C 1014 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 NUP2YLR335W 2163 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RGP1YDR137W 1992 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 IKS1YJL057C 2004 nt3.87□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 FAA1YOR317W 2103 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YHL012WYHL012W 1482 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 OCT1YKL134C 2319 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 PER1YCR044C 1074 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RPP1AYDL081C 321 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 snR7-SsnR7-S 179 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YDR274CYDR274C 372 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YIL163CYIL163C 354 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RFC2YJR068W 1062 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YLR225CYLR225C 1224 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 VPS71YML041C 843 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 BSD2YBR290W 966 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 MNL1YHR204W 2391 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RTC1YOL138C 4026 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 GPI10YGL142C 1851 nt3.86□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 VMA22YHR060W 546 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 TTI2YJR136C 1266 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 MRT4YKL009W 711 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 IES3YLR052W 753 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YAR023CYAR023C 540 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YOL024WYOL024W 519 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YOR008W-BYOR008W-B 102 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 SAT4YCR008W 1812 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 ABD1YBR236C 1311 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 LAP3YNL239W 1365 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 ADP1YCR011C 3150 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 MET4YNL103W 2019 nt3.85□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 NHX1YDR456W 1902 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 RIM4YHL024W 2142 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 COX2Q0250 756 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YIL021C-AYIL021C-A 270 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 IDI1YPL117C 867 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 YPR071WYPR071W 636 nt3.84□□□□□ -1.79
HMS1Q12398 FLO8YER109C 2400 nt3.84□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YIL001WYIL001W 1542 nt3.84□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 TGL1YKL140W 1647 nt3.84□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 LYP1YNL268W 1836 nt3.84□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 DPH6YLR143W 2058 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 JHD2YJR119C 2187 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 NTH1YDR001C 2256 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 OCA4YCR095C 1089 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 PHO92YDR374C 921 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 LOH1YJL038C 660 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 VPS28YPL065W 729 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 GPI2YPL076W 843 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YPL114WYPL114W 420 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YPL278CYPL278C 303 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 PUS9YDL036C 1389 nt3.83□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 VMA1YDL185W 3216 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SIR1YKR101W 1965 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 ALG9YNL219C 1668 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 BUD13YGL174W 801 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 FRA2YGL220W 363 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SFH5YJL145W 885 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YOR342CYOR342C 960 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 BRE4YDL231C 3378 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 RPO31YOR116C 4383 nt3.82□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YCF1YDR135C 4548 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SLM5YCR024C 1479 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 RIA1YNL163C 3333 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 APC1YNL172W 5247 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 NUP42YDR192C 1293 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 IRC6YFR043C 714 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YGL188CYGL188C 174 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 LSB1YGR136W 726 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SNL1YIL016W 480 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SPS19YNL202W 879 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SUA7YPR086W 1038 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SHE3YBR130C 1278 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 HOYDL227C 1761 nt3.81□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 GRX6YDL010W 696 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YDR056CYDR056C 618 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SEM1YDR363W-A 270 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 BNA6YFR047C 888 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YNK1YKL067W 462 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 NKP2YLR315W 462 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 SWC7YLR385C 399 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 YDC1YPL087W 954 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 CMR3YPR013C 954 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 TIF5YPR041W 1218 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 KRE5YOR336W 4098 nt3.8□□□□□ -1.8
HMS1Q12398 PRR2YDL214C 2100 nt3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms