Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 RER1YCL001W 567 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CDC48YDL126C 2508 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 GRC3YLL035W 1899 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PMT4YJR143C 2289 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 GDH2YDL215C 3279 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 TGL1YKL140W 1647 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 XKS1YGR194C 1803 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 TOG1YER184C 2385 nt4.02□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CUS1YMR240C 1311 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDR444WYDR444W 2064 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YHL012WYHL012W 1482 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YER085CYER085C 522 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 MTM1YGR257C 1101 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YHR137C-AYHR137C-A 651 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RPS4BYHR203C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RPS4AYJR145C 786 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YRA2YKL214C 612 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 ALG6YOR002W 1635 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PMC1YGL006W 3522 nt4.01□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 FDC1YDR539W 1512 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YPL260WYPL260W 1656 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SIR1YKR101W 1965 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 BUD16YEL029C 939 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SUP56tL(CAA)A 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SUP53tL(CAA)C 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SUP54tL(CAA)G2 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 IRC6YFR043C 714 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RPL14AYKL006W 417 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YLR225CYLR225C 1224 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 LTO1YNL260C 597 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YOR379CYOR379C 339 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SET6YPL165C 1122 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 MET16YPR167C 786 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 OM14YBR230C 405 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PEX34YCL056C 435 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 KTR7YIL085C 1554 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PEX30YLR324W 1572 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PRM2YIL037C 1971 nt4□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 GAD1YMR250W 1758 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 TAF12YDR145W 1620 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PER1YCR044C 1074 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDR222WYDR222W 1248 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 FRA2YGL220W 363 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YIL165CYIL165C 360 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CYC1YJR048W 330 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YLR326WYLR326W 723 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SPO20YMR017W 1194 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 GPI12YMR281W 915 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 VPS68YOL129W 555 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 MFM1YPL060W 1242 nt3.99□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YML020WYML020W 1995 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 TYW1YPL207W 2433 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CPR4YCR069W 957 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDL157CYDL157C 357 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDR282CYDR282C 1245 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YIL152WYIL152W 708 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YJL218WYJL218W 591 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YLR374CYLR374C 390 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 MDM12YOL009C 816 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 PRR2YDL214C 2100 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RIA1YNL163C 3333 nt3.98□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 IMD2YHR216W 1572 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 POL12YBL035C 2118 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDL026WYDL026W 312 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 ARG82YDR173C 1068 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YDR336WYDR336W 945 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 SNA2YDR525W-A 240 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YER138W-AYER138W-A 105 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YER145C-AYER145C-A 438 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YHL034W-AYHL034W-A 462 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CNB1YKL190W 528 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 GMH1YKR030W 822 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YLR198CYLR198C 360 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RSF1YMR030W 1131 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YMR315WYMR315W 1050 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YOL166CYOL166C 339 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YOR034C-AYOR034C-A 243 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CBP3YPL215W 1008 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 TCM62YBR044C 1719 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YCR023CYCR023C 1836 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 CNA1YLR433C 1662 nt3.97□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 RPG1YBR079C 2895 nt3.96□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 FMP30YPL103C 1407 nt3.96□□□□□ -1.77
TMS1Q12116 YOL153CYOL153C 1746 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 TMA17YDL110C 453 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 RPC53YDL150W 1269 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 YDR056CYDR056C 618 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 LPP1YDR503C 825 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 COS4YFL062W 1140 nt3.96□□□□□ -1.78
TMS1Q12116 Q0144Q0144 330 nt3.96□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 47.6 ms