Protein–RNA interactions for Protein: Q12060

HFI1, Transcriptional coactivator HFI1/ADA1, yeastyeast

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HFI1Q12060 GRX4YER174C 735 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YGL177WYGL177W 348 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YGL193CYGL193C 312 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YJR085CYJR085C 318 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 GCD7YLR291C 1146 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 ELO3YLR372W 1038 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 RRG9YNL213C 645 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 SOL1YNR034W 966 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 TAZ1YPR140W 1146 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 RPS9BYBR189W 588 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 LDH1YBR204C 1128 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 RER1YCL001W 567 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 POL31YJR006W 1464 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 PSE1YMR308C 3270 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 Q0255Q0255 1419 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 HSE1YHL002W 1359 nt5.04□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 HSP82YPL240C 2130 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 ALD3YMR169C 1521 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 ALD2YMR170C 1521 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 AFT1YGL071W 2073 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 APL6YGR261C 2430 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 CPR1YDR155C 489 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YDR417CYDR417C 372 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 LYS5YGL154C 819 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YNK1YKL067W 462 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YNL057WYNL057W 333 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YNL303WYNL303W 348 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 snR10snR10 245 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YPL114WYPL114W 420 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 BMT2YBR141C 1014 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 YBR292CYBR292C 372 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 UBA2YDR390C 1911 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 ARN1YHL040C 1884 nt5.03□□□□□ -1.6
HFI1Q12060 LEU1YGL009C 2340 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 TUP1YCR084C 2142 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SEC39YLR440C 2130 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 RDI1YDL135C 609 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MHF2YDL160C-A 243 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 DAS2YDR020C 699 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 PEX14YGL153W 1026 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 PER33YLR064W 822 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 CYC2YOR037W 1101 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YBR013CYBR013C 390 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 IMD3YLR432W 1572 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 ECM18YDR125C 1362 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 DBF4YDR052C 2115 nt5.02□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SPR28YDR218C 1272 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YER067C-AYER067C-A 324 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 NPY1YGL067W 1155 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 PXR1YGR280C 816 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 CUP1-1YHR053C 186 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 CUP1-2YHR055C 186 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SOL3YHR163W 750 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SMD3YLR147C 306 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YML057C-AYML057C-A 390 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SAP30YMR263W 606 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 ARA1YBR149W 1035 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 RCK2YLR248W 1833 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MEF2YJL102W 2460 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 KRS1YDR037W 1776 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YEH2YLR020C 1617 nt5.01□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 APC4YDR118W 1959 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 ARF2YDL137W 546 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YMR315WYMR315W 1050 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 PRX1YBL064C 786 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YBL096CYBL096C 309 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MRM1YOR201C 1239 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YPR071WYPR071W 636 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 QCR2YPR191W 1107 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MBP1YDL056W 2502 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 POL12YBL035C 2118 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 ALG11YNL048W 1647 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 KCC4YCL024W 3114 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SOF1YLL011W 1470 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 GMC1YDR506C 1827 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SNF3YDL194W 2655 nt5□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SSA2YLL024C 1920 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 NOP58YOR310C 1536 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MSA1YOR066W 1890 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 ECM32YER176W 3366 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YCL068CYCL068C 783 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 AAD4YDL243C 990 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 TAF10YDR167W 621 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 VMA22YHR060W 546 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 BET1YIL004C 429 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 GPN3YLR243W 819 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 PEX27YOR193W 1131 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YOR314WYOR314W 330 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 SPP381YBR152W 876 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 UMP1YBR173C 447 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 MIH1YMR036C 1665 nt4.99□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 KAR2YJL034W 2049 nt4.98□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 snR7-LsnR7-L 214 nt4.98□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 YHR054CYHR054C 1065 nt4.98□□□□□ -1.61
HFI1Q12060 USB1YLR132C 873 nt4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.2 ms