Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
SSRP1Q08945 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SSRP1Q08945 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SSRP1Q08945 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms