Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFF3Q07654 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TFF3Q07654 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
TFF3Q07654 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms