Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKAP4Q07065 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKAP4Q07065 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKAP4Q07065 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms