Protein–RNA interactions for Protein: Q05901

CHRNB3, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB3Q05901 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CHRNB3Q05901 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNB3Q05901 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNB3Q05901 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms