Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRSF11Q05519 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRSF11Q05519 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms