Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PTK2Q05397 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTK2Q05397 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms