Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
EGR4Q05215 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EGR4Q05215 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms