Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SSBP1Q04837 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SSBP1Q04837 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms