Protein–RNA interactions for Protein: Q04759

PRKCQ, Protein kinase C theta type, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCQQ04759 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKCQQ04759 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKCQQ04759 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms