Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
OCA2Q04671 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OCA2Q04671 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
OCA2Q04671 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
OCA2Q04671 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
OCA2Q04671 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
OCA2Q04671 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
OCA2Q04671 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms