Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CACNB1Q02641 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CACNB1Q02641 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CACNB1Q02641 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms