Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BNC1Q01954 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms