Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SATB1Q01826 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SATB1Q01826 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms