Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EXOSC10Q01780 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
EXOSC10Q01780 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms