Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CACNA1DQ01668 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CACNA1DQ01668 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CACNA1DQ01668 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms