Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PSG4Q00888 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PSG4Q00888 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PSG4Q00888 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms