Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NFKB2Q00653 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NFKB2Q00653 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms