Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FANCCQ00597 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms