Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CDK3Q00526 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CDK3Q00526 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms