Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
HOXC5Q00444 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HOXC5Q00444 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms