Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CRB1P82279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CRB1P82279 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CRB1P82279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CRB1P82279 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
CRB1P82279 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRB1P82279 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRB1P82279 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CRB1P82279 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CRB1P82279 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CRB1P82279 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CRB1P82279 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CRB1P82279 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CRB1P82279 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CRB1P82279 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms