Protein–RNA interactions for Protein: P78396

CCNA1, Cyclin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA1P78396 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNA1P78396 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNA1P78396 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms