Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOMO3P69849 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOMO3P69849 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms