Protein–RNA interactions for Protein: P68036

UBE2L3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2L3P68036 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
UBE2L3P68036 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
UBE2L3P68036 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
UBE2L3P68036 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms