Protein–RNA interactions for Protein: P63316

TNNC1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC1P63316 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNNC1P63316 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TNNC1P63316 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms