Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERVK_113P63121 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERVK_113P63121 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms