Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PSMC1P62191 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PSMC1P62191 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PSMC1P62191 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms