Protein–RNA interactions for Protein: P61966

AP1S1, AP-1 complex subunit sigma-1A, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S1P61966 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP1S1P61966 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP1S1P61966 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1229.4 ms