Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCCD1P59942 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCCD1P59942 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms