Protein–RNA interactions for Protein: P59091

LINC00315, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00315, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00315P59091 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LINC00315P59091 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LINC00315P59091 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms