Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNX16P57768 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNX16P57768 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNX16P57768 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNX16P57768 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNX16P57768 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNX16P57768 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNX16P57768 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNX16P57768 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNX16P57768 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms