Protein–RNA interactions for Protein: P55774

CCL18, C-C motif chemokine 18, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL18P55774 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL18P55774 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCL18P55774 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL18P55774 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL18P55774 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CCL18P55774 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCL18P55774 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCL18P55774 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL18P55774 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CCL18P55774 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms