Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BRPF1P55201 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
BRPF1P55201 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BRPF1P55201 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms