Protein–RNA interactions for Protein: P54646

PRKAA2, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA2P54646 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PRKAA2P54646 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PRKAA2P54646 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms